在虚开增值税专用发票、用于抵扣税款发票的犯罪中，法定代表人杨某甲起主要作用，是主犯；财务总监杨某某受法定代表人杨某甲指派和安排，起辅助作用，是从犯，判决财务总监杨某某犯虚开增值税专用发票、用于抵扣税款发票罪，判处有期徒刑七年；本案涵盖了关于公司虚开增值税专用发票、用于抵扣税款发票的刑事罪名。